Развитие инновационной деятельности – необходимая основа для функционирования современного общества. Внедрение инноваций в агропромышленный рынок – особо сложная задача в сложившейся экономико-политической ситуации России. Большой запас природных богатств (площади плодородных почв, запасы пресной воды, лесные массивы) являются одной из главных причин экстенсивного развития сельского хозяйства нашей страны. Однако если 100-150 лет назад запас природных богатств позволял компенсировать использование достижений научно-технического прогресса в развитых странах, то в современном мире без внедрения инноваций в АПК сложно удовлетворить потребности общества.

В настоящее время в России существует следующая система развития  инновационной деятельности  АПК на различных уровнях управления:

1 уровень – органы государственной власти (Министерство сельского хозяйства РФ) формируют инновационную политику, отраслевую инновационную систему, создает инновационную базу, планирует мероприятия и выделяет средства в рамках целевых программ;

2 уровень – региональные органы власти (Министерства сельского хозяйства субъектов РФ) разрабатывают региональные программы, стимулирующие повышение инновационной активности, привлекают научные организации и инвесторов в инновационный процесс. Результаты завершенных научных исследований институтов передаются министерствам и ведомствам АПК, региональным и муниципальным органам, которые проводят экспертную оценку и планируют использование их при разработке проектов и программ реализации конкретных научных достижений на предприятиях.

3 уровень – организации АПК. Руководителями и специалистами структурных подразделений организаций происходит планирование инновационной деятельности, как части стратегии, осуществляется непосредственное внедрение инноваций в производственную деятельность, происходит оценка экономического эффекта и разработка корректирующих мероприятий.

Успешное инновационное развитие агропромышленного комплекса России невозможно без существенной поддержки государства. Международный и отечественный опыт показывает, что внедрение инноваций организациями АПК будет осуществляться наиболее эффективно при хорошо сформированной институциональной среде и в рамках государственных целевых программ.

В настоящее время главным ориентиром инновационного развития АПК является Государственная программа развития сельского хозяйства и регулирования рынков сельскохозяйственной продукции, сырья и продовольствия на 2013-2020 годы, которая направлена на обеспечение роста экономики за счет развития инноваций. Во исполнение программы реализуются крупнейшие инновационные проекты: молочно-товарные фермы, мясокомбинаты, овощехранилища, высоко-технологичные теплицы, системы капельного орошения и т.п. В то же время развивается инфраструктура экспорта зерна, мяса крупного рогатого скота при участии фермерских хозяйств .

Целью программы является перевод АПК к 2020г. на инновационный путь развития и повышение на этой основе темпов роста производства и конкурентоспособности товаропроизводителей до уровня развитых стран, находящихся в аналогичных агроклиматических условиях .

Активизация инновационной деятельности в АПК должна быть направлена на освоение достижений научно-технического прогресса и результатов научно-исследовательских работ, которые станут основой повышения эффективности агропромышленного производства. Научно- технические разработки и нововведения выступают как промежуточный результат научно-производственного цикла и по мере практического применения превращаются в научно-техническую инновацию.

Однако непосредственное внедрение инноваций в производственную деятельность должно осуществляться руководителями и специалистами структурных подразделений организаций. Их главной задачей становится не только планирование, но и контроль хода выполнения необходимых мероприятий по освоению инноваций. Успешное освоение инноваций во многом зависит от того, насколько плодотворно будет сотрудничество ученых с руководителями и специалистами организаций, соединяющих науку с производством.

Инновационное развитие агропромышленного комплекса – сложная комплексная проблема, в решении которой особое место играет государственное регулирование и стимулирование. Эффективным вариантом организации инновационной деятельности в организациях АПК должно стать активное участие государственного капитала в превращении технических и технологических идей в новые технологии и доведения их в производство  с целью повышения эффективности и конкурентоспособности отечественных товаропроизводителей.